Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
P18528 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P18528 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P18528 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P18528 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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