Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
H2-Eb1P04230 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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H2-Eb1P04230 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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H2-Eb1P04230 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
H2-Eb1P04230 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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