Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa7P02830 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms