Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cfdp1O88271 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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