Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lnx1O70263 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Lnx1O70263 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lnx1O70263 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Lnx1O70263 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lnx1O70263 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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