Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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