Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm20828J3KMI7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20828J3KMI7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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