Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20517G3UVU6 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20517G3UVU6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms