Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arid4aF8VPQ2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arid4aF8VPQ2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms