Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc6D3YZP9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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