Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PtprbB2RU80 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PtprbB2RU80 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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PtprbB2RU80 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprbB2RU80 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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