Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Trabd2bB1ATG9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Trabd2bB1ATG9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Trabd2bB1ATG9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Trabd2bB1ATG9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Trabd2bB1ATG9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Trabd2bB1ATG9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trabd2bB1ATG9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms