Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

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Length 1,946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chd5A2A8L1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chd5A2A8L1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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