Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Pdpk1Q9Z2A0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pdpk1Q9Z2A0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pdpk1Q9Z2A0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pdpk1Q9Z2A0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Pdpk1Q9Z2A0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pdpk1Q9Z2A0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pdpk1Q9Z2A0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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