Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms