Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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SH3BP1Q9Y3L3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP1Q9Y3L3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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