Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms