Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col4a3Q9QZS0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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