Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rb1cc1Q9ESK9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rb1cc1Q9ESK9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms