Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Efhd1Q9D4J1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Efhd1Q9D4J1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Efhd1Q9D4J1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Efhd1Q9D4J1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Efhd1Q9D4J1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Efhd1Q9D4J1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Efhd1Q9D4J1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Efhd1Q9D4J1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms