Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2fQ9CY34 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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