Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx7Q9CY18 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx7Q9CY18 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx7Q9CY18 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx7Q9CY18 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx7Q9CY18 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx7Q9CY18 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms