Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smurf1Q9CUN6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smurf1Q9CUN6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smurf1Q9CUN6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smurf1Q9CUN6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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