Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atg3Q9CPX6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg3Q9CPX6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms