Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ubqln4Q99NB8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ubqln4Q99NB8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ubqln4Q99NB8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ubqln4Q99NB8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ubqln4Q99NB8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln4Q99NB8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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