Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csmd1Q923L3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms