Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pitrm1Q8K411 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms