Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim68Q8K243 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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