Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek9Q8K1R7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms