Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Znf428Q8C1M2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf428Q8C1M2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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