Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek11Q8C0Q4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nek11Q8C0Q4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nek11Q8C0Q4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nek11Q8C0Q4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nek11Q8C0Q4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek11Q8C0Q4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms