Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmod1Q8BVA4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms