Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gja3Q64448 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gja3Q64448 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gja3Q64448 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja3Q64448 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms