Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SspnQ62147 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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