Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MslnQ61468 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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MslnQ61468 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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MslnQ61468 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
MslnQ61468 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MslnQ61468 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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MslnQ61468 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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MslnQ61468 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
MslnQ61468 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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MslnQ61468 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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MslnQ61468 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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MslnQ61468 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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MslnQ61468 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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MslnQ61468 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MslnQ61468 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms