Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BcanQ61361 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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