Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CttnQ60598 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CttnQ60598 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CttnQ60598 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms