Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D130052B06RikQ3UW13 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D130052B06RikQ3UW13 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms