Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm6899Q3USS0 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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