Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp30Q3UN04 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp30Q3UN04 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usp30Q3UN04 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp30Q3UN04 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp30Q3UN04 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp30Q3UN04 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Usp30Q3UN04 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp30Q3UN04 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms