Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Nkx6-3Q3UHX8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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