Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Akr1c20-201ENSMUST00000078239 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnf166Q3U9F6 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Dlx5-201ENSMUST00000052609 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnf166Q3U9F6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms