Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Traf3ip1Q149C2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms