Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Spatc1Q148B6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Spatc1Q148B6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Spatc1Q148B6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Spatc1Q148B6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Spatc1Q148B6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Spatc1Q148B6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Spatc1Q148B6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Spatc1Q148B6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Spatc1Q148B6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Spatc1Q148B6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms