Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim24Q0VG18 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim24Q0VG18 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim24Q0VG18 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim24Q0VG18 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim24Q0VG18 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim24Q0VG18 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim24Q0VG18 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim24Q0VG18 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim24Q0VG18 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms