Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Samd12Q0VE29 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Samd12Q0VE29 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms