Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps8Q0P5W1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps8Q0P5W1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms