Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms