Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf541Q0GGX2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms