Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm3Q08189 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms